Protein–RNA interactions for Protein: A6XGL0

YJEFN3, YjeF N-terminal domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YJEFN3A6XGL0 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
YJEFN3A6XGL0 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
YJEFN3A6XGL0 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
YJEFN3A6XGL0 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
YJEFN3A6XGL0 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
YJEFN3A6XGL0 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
YJEFN3A6XGL0 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
YJEFN3A6XGL0 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
YJEFN3A6XGL0 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
YJEFN3A6XGL0 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
YJEFN3A6XGL0 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
YJEFN3A6XGL0 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
YJEFN3A6XGL0 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
YJEFN3A6XGL0 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
YJEFN3A6XGL0 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
YJEFN3A6XGL0 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
YJEFN3A6XGL0 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
YJEFN3A6XGL0 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
YJEFN3A6XGL0 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
YJEFN3A6XGL0 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YJEFN3A6XGL0 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YJEFN3A6XGL0 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YJEFN3A6XGL0 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YJEFN3A6XGL0 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YJEFN3A6XGL0 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YJEFN3A6XGL0 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
YJEFN3A6XGL0 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YJEFN3A6XGL0 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YJEFN3A6XGL0 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YJEFN3A6XGL0 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YJEFN3A6XGL0 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YJEFN3A6XGL0 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YJEFN3A6XGL0 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YJEFN3A6XGL0 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YJEFN3A6XGL0 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YJEFN3A6XGL0 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YJEFN3A6XGL0 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
YJEFN3A6XGL0 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YJEFN3A6XGL0 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YJEFN3A6XGL0 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YJEFN3A6XGL0 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
YJEFN3A6XGL0 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YJEFN3A6XGL0 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YJEFN3A6XGL0 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YJEFN3A6XGL0 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YJEFN3A6XGL0 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YJEFN3A6XGL0 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
YJEFN3A6XGL0 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YJEFN3A6XGL0 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YJEFN3A6XGL0 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YJEFN3A6XGL0 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YJEFN3A6XGL0 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YJEFN3A6XGL0 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YJEFN3A6XGL0 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YJEFN3A6XGL0 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YJEFN3A6XGL0 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YJEFN3A6XGL0 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YJEFN3A6XGL0 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YJEFN3A6XGL0 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YJEFN3A6XGL0 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YJEFN3A6XGL0 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YJEFN3A6XGL0 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YJEFN3A6XGL0 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
YJEFN3A6XGL0 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YJEFN3A6XGL0 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
YJEFN3A6XGL0 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
YJEFN3A6XGL0 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YJEFN3A6XGL0 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
YJEFN3A6XGL0 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YJEFN3A6XGL0 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YJEFN3A6XGL0 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
YJEFN3A6XGL0 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
YJEFN3A6XGL0 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YJEFN3A6XGL0 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
YJEFN3A6XGL0 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YJEFN3A6XGL0 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
YJEFN3A6XGL0 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YJEFN3A6XGL0 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YJEFN3A6XGL0 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
YJEFN3A6XGL0 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YJEFN3A6XGL0 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YJEFN3A6XGL0 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YJEFN3A6XGL0 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
YJEFN3A6XGL0 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
YJEFN3A6XGL0 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
YJEFN3A6XGL0 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YJEFN3A6XGL0 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
YJEFN3A6XGL0 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
YJEFN3A6XGL0 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YJEFN3A6XGL0 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
YJEFN3A6XGL0 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YJEFN3A6XGL0 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
YJEFN3A6XGL0 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
YJEFN3A6XGL0 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
YJEFN3A6XGL0 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
YJEFN3A6XGL0 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
YJEFN3A6XGL0 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YJEFN3A6XGL0 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
YJEFN3A6XGL0 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YJEFN3A6XGL0 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms