Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms