Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms