Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms