Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms