Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CCDC180Q9P1Z9 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms