Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXK8

FBXL12, F-box/LRR-repeat protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL12Q9NXK8 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXL12Q9NXK8 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXL12Q9NXK8 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXL12Q9NXK8 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXL12Q9NXK8 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXL12Q9NXK8 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXL12Q9NXK8 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXL12Q9NXK8 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXL12Q9NXK8 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXL12Q9NXK8 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXL12Q9NXK8 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXL12Q9NXK8 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXL12Q9NXK8 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXL12Q9NXK8 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXL12Q9NXK8 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXL12Q9NXK8 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXL12Q9NXK8 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXL12Q9NXK8 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXL12Q9NXK8 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXL12Q9NXK8 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXL12Q9NXK8 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXL12Q9NXK8 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXL12Q9NXK8 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXL12Q9NXK8 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXL12Q9NXK8 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXL12Q9NXK8 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXL12Q9NXK8 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL12Q9NXK8 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL12Q9NXK8 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL12Q9NXK8 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL12Q9NXK8 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL12Q9NXK8 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL12Q9NXK8 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL12Q9NXK8 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL12Q9NXK8 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL12Q9NXK8 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL12Q9NXK8 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL12Q9NXK8 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL12Q9NXK8 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL12Q9NXK8 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL12Q9NXK8 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL12Q9NXK8 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL12Q9NXK8 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL12Q9NXK8 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL12Q9NXK8 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL12Q9NXK8 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL12Q9NXK8 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL12Q9NXK8 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL12Q9NXK8 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL12Q9NXK8 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL12Q9NXK8 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL12Q9NXK8 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL12Q9NXK8 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL12Q9NXK8 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL12Q9NXK8 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL12Q9NXK8 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL12Q9NXK8 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL12Q9NXK8 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL12Q9NXK8 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL12Q9NXK8 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL12Q9NXK8 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL12Q9NXK8 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL12Q9NXK8 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL12Q9NXK8 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL12Q9NXK8 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL12Q9NXK8 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL12Q9NXK8 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL12Q9NXK8 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL12Q9NXK8 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL12Q9NXK8 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL12Q9NXK8 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL12Q9NXK8 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL12Q9NXK8 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL12Q9NXK8 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL12Q9NXK8 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL12Q9NXK8 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FBXL12Q9NXK8 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FBXL12Q9NXK8 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FBXL12Q9NXK8 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FBXL12Q9NXK8 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FBXL12Q9NXK8 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FBXL12Q9NXK8 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FBXL12Q9NXK8 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FBXL12Q9NXK8 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FBXL12Q9NXK8 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FBXL12Q9NXK8 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FBXL12Q9NXK8 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FBXL12Q9NXK8 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FBXL12Q9NXK8 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FBXL12Q9NXK8 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FBXL12Q9NXK8 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FBXL12Q9NXK8 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FBXL12Q9NXK8 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FBXL12Q9NXK8 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FBXL12Q9NXK8 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FBXL12Q9NXK8 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FBXL12Q9NXK8 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FBXL12Q9NXK8 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FBXL12Q9NXK8 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FBXL12Q9NXK8 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms