Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms