Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ7

PCDHB16, Protocadherin beta-16, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB16Q9NRJ7 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCDHB16Q9NRJ7 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCDHB16Q9NRJ7 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCDHB16Q9NRJ7 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCDHB16Q9NRJ7 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCDHB16Q9NRJ7 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCDHB16Q9NRJ7 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCDHB16Q9NRJ7 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCDHB16Q9NRJ7 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCDHB16Q9NRJ7 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCDHB16Q9NRJ7 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCDHB16Q9NRJ7 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCDHB16Q9NRJ7 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCDHB16Q9NRJ7 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCDHB16Q9NRJ7 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCDHB16Q9NRJ7 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCDHB16Q9NRJ7 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCDHB16Q9NRJ7 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCDHB16Q9NRJ7 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCDHB16Q9NRJ7 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCDHB16Q9NRJ7 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCDHB16Q9NRJ7 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCDHB16Q9NRJ7 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCDHB16Q9NRJ7 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCDHB16Q9NRJ7 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCDHB16Q9NRJ7 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCDHB16Q9NRJ7 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCDHB16Q9NRJ7 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCDHB16Q9NRJ7 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCDHB16Q9NRJ7 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCDHB16Q9NRJ7 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCDHB16Q9NRJ7 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCDHB16Q9NRJ7 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCDHB16Q9NRJ7 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCDHB16Q9NRJ7 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCDHB16Q9NRJ7 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCDHB16Q9NRJ7 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PCDHB16Q9NRJ7 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCDHB16Q9NRJ7 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PCDHB16Q9NRJ7 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCDHB16Q9NRJ7 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCDHB16Q9NRJ7 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCDHB16Q9NRJ7 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PCDHB16Q9NRJ7 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCDHB16Q9NRJ7 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCDHB16Q9NRJ7 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCDHB16Q9NRJ7 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCDHB16Q9NRJ7 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCDHB16Q9NRJ7 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCDHB16Q9NRJ7 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCDHB16Q9NRJ7 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCDHB16Q9NRJ7 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCDHB16Q9NRJ7 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCDHB16Q9NRJ7 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCDHB16Q9NRJ7 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCDHB16Q9NRJ7 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCDHB16Q9NRJ7 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCDHB16Q9NRJ7 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCDHB16Q9NRJ7 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCDHB16Q9NRJ7 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCDHB16Q9NRJ7 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCDHB16Q9NRJ7 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCDHB16Q9NRJ7 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCDHB16Q9NRJ7 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PCDHB16Q9NRJ7 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PCDHB16Q9NRJ7 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PCDHB16Q9NRJ7 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
PCDHB16Q9NRJ7 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PCDHB16Q9NRJ7 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PCDHB16Q9NRJ7 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PCDHB16Q9NRJ7 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PCDHB16Q9NRJ7 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PCDHB16Q9NRJ7 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PCDHB16Q9NRJ7 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PCDHB16Q9NRJ7 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCDHB16Q9NRJ7 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCDHB16Q9NRJ7 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCDHB16Q9NRJ7 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCDHB16Q9NRJ7 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCDHB16Q9NRJ7 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCDHB16Q9NRJ7 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PCDHB16Q9NRJ7 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCDHB16Q9NRJ7 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCDHB16Q9NRJ7 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCDHB16Q9NRJ7 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCDHB16Q9NRJ7 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PCDHB16Q9NRJ7 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCDHB16Q9NRJ7 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCDHB16Q9NRJ7 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PCDHB16Q9NRJ7 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCDHB16Q9NRJ7 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCDHB16Q9NRJ7 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCDHB16Q9NRJ7 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCDHB16Q9NRJ7 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCDHB16Q9NRJ7 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCDHB16Q9NRJ7 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PCDHB16Q9NRJ7 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PCDHB16Q9NRJ7 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCDHB16Q9NRJ7 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCDHB16Q9NRJ7 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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