Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms