Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP08

HMX1, Homeobox protein HMX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX1Q9NP08 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HMX1Q9NP08 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HMX1Q9NP08 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HMX1Q9NP08 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HMX1Q9NP08 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HMX1Q9NP08 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HMX1Q9NP08 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HMX1Q9NP08 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HMX1Q9NP08 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HMX1Q9NP08 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HMX1Q9NP08 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HMX1Q9NP08 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HMX1Q9NP08 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HMX1Q9NP08 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HMX1Q9NP08 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HMX1Q9NP08 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HMX1Q9NP08 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HMX1Q9NP08 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HMX1Q9NP08 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
HMX1Q9NP08 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HMX1Q9NP08 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HMX1Q9NP08 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HMX1Q9NP08 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HMX1Q9NP08 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HMX1Q9NP08 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HMX1Q9NP08 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HMX1Q9NP08 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
HMX1Q9NP08 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
HMX1Q9NP08 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HMX1Q9NP08 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HMX1Q9NP08 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HMX1Q9NP08 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HMX1Q9NP08 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HMX1Q9NP08 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HMX1Q9NP08 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HMX1Q9NP08 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HMX1Q9NP08 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HMX1Q9NP08 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HMX1Q9NP08 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HMX1Q9NP08 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HMX1Q9NP08 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HMX1Q9NP08 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HMX1Q9NP08 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX1Q9NP08 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX1Q9NP08 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX1Q9NP08 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX1Q9NP08 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX1Q9NP08 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX1Q9NP08 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX1Q9NP08 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX1Q9NP08 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX1Q9NP08 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX1Q9NP08 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX1Q9NP08 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX1Q9NP08 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX1Q9NP08 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX1Q9NP08 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX1Q9NP08 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX1Q9NP08 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX1Q9NP08 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX1Q9NP08 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX1Q9NP08 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX1Q9NP08 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX1Q9NP08 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX1Q9NP08 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX1Q9NP08 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX1Q9NP08 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX1Q9NP08 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX1Q9NP08 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX1Q9NP08 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX1Q9NP08 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX1Q9NP08 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX1Q9NP08 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX1Q9NP08 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX1Q9NP08 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX1Q9NP08 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX1Q9NP08 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX1Q9NP08 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX1Q9NP08 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX1Q9NP08 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX1Q9NP08 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX1Q9NP08 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX1Q9NP08 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX1Q9NP08 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX1Q9NP08 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX1Q9NP08 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMX1Q9NP08 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMX1Q9NP08 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMX1Q9NP08 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMX1Q9NP08 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMX1Q9NP08 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMX1Q9NP08 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMX1Q9NP08 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMX1Q9NP08 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMX1Q9NP08 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMX1Q9NP08 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMX1Q9NP08 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMX1Q9NP08 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMX1Q9NP08 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HMX1Q9NP08 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms