Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC96

CAPN10, Calpain-10, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN10Q9HC96 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN10Q9HC96 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN10Q9HC96 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN10Q9HC96 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN10Q9HC96 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN10Q9HC96 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN10Q9HC96 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN10Q9HC96 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN10Q9HC96 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN10Q9HC96 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN10Q9HC96 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN10Q9HC96 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN10Q9HC96 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN10Q9HC96 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN10Q9HC96 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN10Q9HC96 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN10Q9HC96 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN10Q9HC96 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN10Q9HC96 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN10Q9HC96 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN10Q9HC96 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN10Q9HC96 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN10Q9HC96 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN10Q9HC96 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN10Q9HC96 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN10Q9HC96 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN10Q9HC96 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN10Q9HC96 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN10Q9HC96 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN10Q9HC96 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN10Q9HC96 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN10Q9HC96 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN10Q9HC96 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN10Q9HC96 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN10Q9HC96 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN10Q9HC96 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN10Q9HC96 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN10Q9HC96 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN10Q9HC96 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN10Q9HC96 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN10Q9HC96 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN10Q9HC96 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN10Q9HC96 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN10Q9HC96 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN10Q9HC96 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN10Q9HC96 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN10Q9HC96 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN10Q9HC96 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN10Q9HC96 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN10Q9HC96 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN10Q9HC96 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN10Q9HC96 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN10Q9HC96 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN10Q9HC96 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN10Q9HC96 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN10Q9HC96 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN10Q9HC96 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN10Q9HC96 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN10Q9HC96 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN10Q9HC96 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN10Q9HC96 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN10Q9HC96 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN10Q9HC96 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN10Q9HC96 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN10Q9HC96 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN10Q9HC96 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN10Q9HC96 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN10Q9HC96 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN10Q9HC96 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN10Q9HC96 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN10Q9HC96 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN10Q9HC96 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN10Q9HC96 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN10Q9HC96 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN10Q9HC96 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN10Q9HC96 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN10Q9HC96 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN10Q9HC96 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN10Q9HC96 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN10Q9HC96 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN10Q9HC96 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN10Q9HC96 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN10Q9HC96 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN10Q9HC96 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN10Q9HC96 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN10Q9HC96 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN10Q9HC96 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN10Q9HC96 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN10Q9HC96 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN10Q9HC96 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN10Q9HC96 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN10Q9HC96 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN10Q9HC96 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN10Q9HC96 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN10Q9HC96 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN10Q9HC96 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN10Q9HC96 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN10Q9HC96 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN10Q9HC96 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN10Q9HC96 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms