Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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