Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K7

STRADB, STE20-related kinase adapter protein beta, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADBQ9C0K7 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
STRADBQ9C0K7 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
STRADBQ9C0K7 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
STRADBQ9C0K7 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
STRADBQ9C0K7 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
STRADBQ9C0K7 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
STRADBQ9C0K7 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
STRADBQ9C0K7 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
STRADBQ9C0K7 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
STRADBQ9C0K7 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
STRADBQ9C0K7 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
STRADBQ9C0K7 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
STRADBQ9C0K7 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
STRADBQ9C0K7 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
STRADBQ9C0K7 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
STRADBQ9C0K7 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
STRADBQ9C0K7 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
STRADBQ9C0K7 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
STRADBQ9C0K7 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
STRADBQ9C0K7 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
STRADBQ9C0K7 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
STRADBQ9C0K7 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
STRADBQ9C0K7 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
STRADBQ9C0K7 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
STRADBQ9C0K7 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
STRADBQ9C0K7 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
STRADBQ9C0K7 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
STRADBQ9C0K7 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
STRADBQ9C0K7 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
STRADBQ9C0K7 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
STRADBQ9C0K7 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
STRADBQ9C0K7 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
STRADBQ9C0K7 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
STRADBQ9C0K7 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
STRADBQ9C0K7 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
STRADBQ9C0K7 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
STRADBQ9C0K7 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
STRADBQ9C0K7 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
STRADBQ9C0K7 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
STRADBQ9C0K7 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
STRADBQ9C0K7 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
STRADBQ9C0K7 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
STRADBQ9C0K7 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
STRADBQ9C0K7 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
STRADBQ9C0K7 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
STRADBQ9C0K7 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
STRADBQ9C0K7 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
STRADBQ9C0K7 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
STRADBQ9C0K7 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
STRADBQ9C0K7 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
STRADBQ9C0K7 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
STRADBQ9C0K7 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
STRADBQ9C0K7 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
STRADBQ9C0K7 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
STRADBQ9C0K7 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
STRADBQ9C0K7 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
STRADBQ9C0K7 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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STRADBQ9C0K7 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
STRADBQ9C0K7 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
STRADBQ9C0K7 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
STRADBQ9C0K7 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
STRADBQ9C0K7 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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STRADBQ9C0K7 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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STRADBQ9C0K7 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
STRADBQ9C0K7 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
STRADBQ9C0K7 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
STRADBQ9C0K7 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
STRADBQ9C0K7 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
STRADBQ9C0K7 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
STRADBQ9C0K7 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
STRADBQ9C0K7 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
STRADBQ9C0K7 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
STRADBQ9C0K7 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
STRADBQ9C0K7 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
STRADBQ9C0K7 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
STRADBQ9C0K7 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
STRADBQ9C0K7 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
STRADBQ9C0K7 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
STRADBQ9C0K7 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
STRADBQ9C0K7 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
STRADBQ9C0K7 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
STRADBQ9C0K7 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
STRADBQ9C0K7 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
STRADBQ9C0K7 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
STRADBQ9C0K7 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
STRADBQ9C0K7 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
STRADBQ9C0K7 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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