Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms