Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D7

ZC3H12C, Probable ribonuclease ZC3H12C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12CQ9C0D7 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ZC3H12CQ9C0D7 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms