Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

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Length 1,298 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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AMBRA1Q9C0C7 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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AMBRA1Q9C0C7 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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AMBRA1Q9C0C7 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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AMBRA1Q9C0C7 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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