Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms