Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms