Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms