Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms