Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms