Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS16

CENPK, Centromere protein K, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPKQ9BS16 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms