Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms