Protein–RNA interactions for Protein: Q96PD5

PGLYRP2, N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGLYRP2Q96PD5 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGLYRP2Q96PD5 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGLYRP2Q96PD5 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGLYRP2Q96PD5 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGLYRP2Q96PD5 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGLYRP2Q96PD5 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGLYRP2Q96PD5 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGLYRP2Q96PD5 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGLYRP2Q96PD5 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGLYRP2Q96PD5 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGLYRP2Q96PD5 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGLYRP2Q96PD5 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGLYRP2Q96PD5 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGLYRP2Q96PD5 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGLYRP2Q96PD5 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGLYRP2Q96PD5 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGLYRP2Q96PD5 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGLYRP2Q96PD5 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGLYRP2Q96PD5 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PGLYRP2Q96PD5 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGLYRP2Q96PD5 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGLYRP2Q96PD5 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGLYRP2Q96PD5 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGLYRP2Q96PD5 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGLYRP2Q96PD5 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PGLYRP2Q96PD5 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGLYRP2Q96PD5 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGLYRP2Q96PD5 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGLYRP2Q96PD5 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGLYRP2Q96PD5 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGLYRP2Q96PD5 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGLYRP2Q96PD5 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGLYRP2Q96PD5 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGLYRP2Q96PD5 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGLYRP2Q96PD5 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGLYRP2Q96PD5 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGLYRP2Q96PD5 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGLYRP2Q96PD5 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGLYRP2Q96PD5 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGLYRP2Q96PD5 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGLYRP2Q96PD5 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGLYRP2Q96PD5 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGLYRP2Q96PD5 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGLYRP2Q96PD5 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGLYRP2Q96PD5 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGLYRP2Q96PD5 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGLYRP2Q96PD5 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGLYRP2Q96PD5 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGLYRP2Q96PD5 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGLYRP2Q96PD5 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGLYRP2Q96PD5 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGLYRP2Q96PD5 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGLYRP2Q96PD5 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGLYRP2Q96PD5 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGLYRP2Q96PD5 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGLYRP2Q96PD5 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGLYRP2Q96PD5 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGLYRP2Q96PD5 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGLYRP2Q96PD5 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGLYRP2Q96PD5 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGLYRP2Q96PD5 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGLYRP2Q96PD5 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGLYRP2Q96PD5 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGLYRP2Q96PD5 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGLYRP2Q96PD5 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGLYRP2Q96PD5 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGLYRP2Q96PD5 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGLYRP2Q96PD5 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGLYRP2Q96PD5 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGLYRP2Q96PD5 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGLYRP2Q96PD5 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGLYRP2Q96PD5 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGLYRP2Q96PD5 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGLYRP2Q96PD5 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGLYRP2Q96PD5 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGLYRP2Q96PD5 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGLYRP2Q96PD5 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PGLYRP2Q96PD5 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGLYRP2Q96PD5 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGLYRP2Q96PD5 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGLYRP2Q96PD5 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGLYRP2Q96PD5 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGLYRP2Q96PD5 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGLYRP2Q96PD5 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGLYRP2Q96PD5 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGLYRP2Q96PD5 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGLYRP2Q96PD5 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGLYRP2Q96PD5 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGLYRP2Q96PD5 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGLYRP2Q96PD5 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGLYRP2Q96PD5 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGLYRP2Q96PD5 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGLYRP2Q96PD5 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGLYRP2Q96PD5 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGLYRP2Q96PD5 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGLYRP2Q96PD5 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGLYRP2Q96PD5 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGLYRP2Q96PD5 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGLYRP2Q96PD5 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PGLYRP2Q96PD5 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms