Protein–RNA interactions for Protein: Q96P69

GPR78, G-protein coupled receptor 78, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR78Q96P69 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms