Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
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