Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY5

MVB12A, Multivesicular body subunit 12A, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12AQ96EY5 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms