Protein–RNA interactions for Protein: Q96D59

RNF183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF183Q96D59 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RNF183Q96D59 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms