Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSRNP3Q8WYN3 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSRNP3Q8WYN3 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSRNP3Q8WYN3 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSRNP3Q8WYN3 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSRNP3Q8WYN3 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CSRNP3Q8WYN3 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CSRNP3Q8WYN3 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSRNP3Q8WYN3 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CSRNP3Q8WYN3 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSRNP3Q8WYN3 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSRNP3Q8WYN3 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSRNP3Q8WYN3 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSRNP3Q8WYN3 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSRNP3Q8WYN3 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSRNP3Q8WYN3 AKR1B10P2-201ENST00000577332 927 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CSRNP3Q8WYN3 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSRNP3Q8WYN3 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSRNP3Q8WYN3 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CSRNP3Q8WYN3 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSRNP3Q8WYN3 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSRNP3Q8WYN3 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CSRNP3Q8WYN3 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSRNP3Q8WYN3 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSRNP3Q8WYN3 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSRNP3Q8WYN3 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSRNP3Q8WYN3 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CSRNP3Q8WYN3 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSRNP3Q8WYN3 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSRNP3Q8WYN3 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CSRNP3Q8WYN3 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CSRNP3Q8WYN3 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CSRNP3Q8WYN3 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CSRNP3Q8WYN3 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CSRNP3Q8WYN3 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CSRNP3Q8WYN3 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CSRNP3Q8WYN3 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CSRNP3Q8WYN3 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CSRNP3Q8WYN3 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CSRNP3Q8WYN3 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CSRNP3Q8WYN3 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CSRNP3Q8WYN3 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CSRNP3Q8WYN3 PAX6-247ENST00000638965 979 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CSRNP3Q8WYN3 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CSRNP3Q8WYN3 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CSRNP3Q8WYN3 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CSRNP3Q8WYN3 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CSRNP3Q8WYN3 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CSRNP3Q8WYN3 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CSRNP3Q8WYN3 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CSRNP3Q8WYN3 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CSRNP3Q8WYN3 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CSRNP3Q8WYN3 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CSRNP3Q8WYN3 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CSRNP3Q8WYN3 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSRNP3Q8WYN3 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSRNP3Q8WYN3 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSRNP3Q8WYN3 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSRNP3Q8WYN3 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSRNP3Q8WYN3 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSRNP3Q8WYN3 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSRNP3Q8WYN3 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSRNP3Q8WYN3 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSRNP3Q8WYN3 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSRNP3Q8WYN3 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSRNP3Q8WYN3 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSRNP3Q8WYN3 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSRNP3Q8WYN3 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSRNP3Q8WYN3 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSRNP3Q8WYN3 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSRNP3Q8WYN3 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSRNP3Q8WYN3 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CSRNP3Q8WYN3 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSRNP3Q8WYN3 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CSRNP3Q8WYN3 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSRNP3Q8WYN3 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CSRNP3Q8WYN3 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSRNP3Q8WYN3 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSRNP3Q8WYN3 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSRNP3Q8WYN3 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CSRNP3Q8WYN3 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSRNP3Q8WYN3 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSRNP3Q8WYN3 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CSRNP3Q8WYN3 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSRNP3Q8WYN3 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSRNP3Q8WYN3 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSRNP3Q8WYN3 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSRNP3Q8WYN3 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSRNP3Q8WYN3 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSRNP3Q8WYN3 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSRNP3Q8WYN3 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSRNP3Q8WYN3 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSRNP3Q8WYN3 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSRNP3Q8WYN3 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSRNP3Q8WYN3 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSRNP3Q8WYN3 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSRNP3Q8WYN3 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSRNP3Q8WYN3 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSRNP3Q8WYN3 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSRNP3Q8WYN3 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms