Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 OPA3-201ENST00000263275 7828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 SCN1B-202ENST00000415950 4537 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 RBM12-202ENST00000374104 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 AFDN-206ENST00000392112 7459 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 APPBP2-201ENST00000083182 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 SEC14L1-204ENST00000436233 5295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 BCL2L13-202ENST00000337612 4905 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 GZF1-202ENST00000377051 4740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 RAD1-203ENST00000382038 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 RIMS1-201ENST00000264839 7055 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 HAUS6-202ENST00000380502 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 C10orf105-202ENST00000441508 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 MBNL1-AS1-202ENST00000608395 6585 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 CLCN4-203ENST00000421085 6534 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 ERBB2-202ENST00000406381 4564 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
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