Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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ZNF548Q8NEK5 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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ZNF548Q8NEK5 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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ZNF548Q8NEK5 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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