Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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CLDN19Q8N6F1 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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CLDN19Q8N6F1 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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CLDN19Q8N6F1 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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CLDN19Q8N6F1 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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CLDN19Q8N6F1 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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CLDN19Q8N6F1 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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CLDN19Q8N6F1 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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