Protein–RNA interactions for Protein: Q8N488

RYBP, RING1 and YY1-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYBPQ8N488 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms