Protein–RNA interactions for Protein: Q8N283

ANKRD35, Ankyrin repeat domain-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD35Q8N283 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD35Q8N283 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD35Q8N283 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD35Q8N283 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD35Q8N283 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD35Q8N283 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD35Q8N283 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD35Q8N283 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD35Q8N283 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD35Q8N283 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD35Q8N283 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD35Q8N283 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD35Q8N283 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD35Q8N283 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD35Q8N283 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD35Q8N283 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD35Q8N283 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD35Q8N283 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD35Q8N283 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD35Q8N283 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD35Q8N283 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD35Q8N283 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD35Q8N283 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD35Q8N283 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD35Q8N283 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD35Q8N283 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD35Q8N283 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD35Q8N283 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD35Q8N283 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD35Q8N283 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD35Q8N283 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD35Q8N283 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD35Q8N283 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD35Q8N283 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD35Q8N283 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD35Q8N283 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD35Q8N283 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD35Q8N283 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD35Q8N283 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD35Q8N283 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD35Q8N283 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD35Q8N283 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD35Q8N283 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD35Q8N283 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD35Q8N283 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD35Q8N283 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD35Q8N283 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD35Q8N283 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD35Q8N283 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD35Q8N283 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD35Q8N283 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD35Q8N283 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD35Q8N283 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD35Q8N283 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD35Q8N283 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD35Q8N283 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD35Q8N283 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD35Q8N283 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD35Q8N283 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD35Q8N283 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD35Q8N283 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD35Q8N283 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD35Q8N283 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD35Q8N283 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD35Q8N283 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD35Q8N283 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD35Q8N283 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD35Q8N283 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD35Q8N283 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD35Q8N283 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD35Q8N283 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD35Q8N283 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD35Q8N283 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD35Q8N283 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD35Q8N283 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD35Q8N283 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD35Q8N283 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD35Q8N283 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD35Q8N283 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD35Q8N283 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD35Q8N283 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD35Q8N283 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD35Q8N283 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD35Q8N283 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD35Q8N283 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD35Q8N283 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD35Q8N283 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD35Q8N283 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD35Q8N283 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD35Q8N283 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD35Q8N283 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD35Q8N283 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD35Q8N283 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD35Q8N283 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD35Q8N283 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD35Q8N283 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD35Q8N283 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD35Q8N283 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD35Q8N283 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ANKRD35Q8N283 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms