Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms