Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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TRAPPC6BQ86SZ2 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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TRAPPC6BQ86SZ2 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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TRAPPC6BQ86SZ2 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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TRAPPC6BQ86SZ2 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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