Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

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Length 139 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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LINC00299Q6ZSB3 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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LINC00299Q6ZSB3 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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LINC00299Q6ZSB3 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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LINC00299Q6ZSB3 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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LINC00299Q6ZSB3 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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LINC00299Q6ZSB3 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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LINC00299Q6ZSB3 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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LINC00299Q6ZSB3 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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LINC00299Q6ZSB3 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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LINC00299Q6ZSB3 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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