Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms