Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms