Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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RAB6CQ53S08 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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RAB6CQ53S08 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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RAB6CQ53S08 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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RAB6CQ53S08 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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RAB6CQ53S08 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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RAB6CQ53S08 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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RAB6CQ53S08 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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RAB6CQ53S08 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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