Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms