Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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CDO1Q16878 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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CDO1Q16878 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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CDO1Q16878 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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CDO1Q16878 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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CDO1Q16878 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.8 ms