Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
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ECM1Q16610 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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