Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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