Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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