Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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