Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms