Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
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NCOA1Q15788 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
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NCOA1Q15788 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
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NCOA1Q15788 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
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NCOA1Q15788 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
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NCOA1Q15788 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
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NCOA1Q15788 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
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NCOA1Q15788 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
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NCOA1Q15788 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
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