Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 AC009446.1-201ENST00000519840 808 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms